本次主線共分為：四個大章的主線劇情；主線之外的間章（支線劇情）。同時想要解鎖劇情就需要跟著任務追踪在本區域尋找對應的線索物或節點。簡單來說就是找關鍵道具，順便檢點加成道具→開新劇情→接著找道具，順便撿加成道具→繼續開新劇情，重複滴幹活。所以指揮官們要做的就是在一次次反復中不斷摸索~由此誕生的問題如下：
Q：劇情很亂不方便看
P：指揮官已經通過的劇情可以在終焉福音界面的戰術檔案裡進行查看，也可以優先推進遊戲然後再回頭看劇情~
Q：總覺得一直在走同樣的路線也不知道對不對….
P：右上角的地圖按鈕將會是您最好的幫手~指揮官可以對照地圖提前規劃自己的行進方向便於回收道具&支線
Q：投點點數不夠怎麼辦？
P :主線第一章通關後會開啟天賦系統~可以再次升級構造體能力或使用加成道具來增加基礎點數（戰備中心→背包可查看道具保有量）
Q：我根本找不到那個關鍵道具
P：關鍵道具可以跟著提示來找，不過同個區域可能有多個間章的檢索，它們各自所需的關鍵道具也不一樣，這種情況就需要指揮官走另一個方向排查下，是否有漏掉的檢索了~
Q：進入區域下一個區域和離開區域圖標分不出來
P：在小地圖上從左往右看高→低為離開標籤；反之低→高為升域標籤
【各關鍵道具位置】
聖甲蟲小隊通訊記錄
二進制笑話
遺落的防禦數據體
數據斷片
格式塔的監控記錄】
作廢的路點
誘餌處理器
